缺失的微生物成分

直到最近，微生物学和宏基因组学领域一直没有被认为是生物学研究的主要领域，一年只有几十个出版物。然而，随着下一代测序（NGS）的出现以及同时对数百万个混合DNA序列进行序列的能力，微生物组和元基因组学研究已扩展到当今几乎包括患者护理在内的生物学研究领域。尽管NGS已经为该数据富含的领域打开了大门，但大多数专家都认识到，将需要重大的技术进步来产生准确而有效的数据集。

由于这种快速扩展以及几乎每个样本处理的高性能协议的需求，需要特别设计的控件和试剂，包括采样收集，DNA和RNA提取，NGS库准备以及特殊的生物信息学软件来了解这些变化德赢体育平台游戏平台在这些步骤中。显然，既需要全细胞微生物参考标准标准和基因组DNA标准标准，以确定检测限制和性能统计数据，包括所有研究（包括这些临床样品）。将微生物参考对照组合为微生物组研究是一种新的必需实践，以确保高质量的实践数据。然而，唯一的来源是众所周知的BEI控制DNA控制，现在很难制造高质量的参考控制，现在供应非常有限。此外，由于有效的微生物裂解是所有微生物组研究中的最高步骤，因此还需要精确定量的DNA和细胞混合微生物标准标准，以确定各种生物体的检测限和恢复百分比。认识到这些需求，三个小组应对挑战并制造了多个微生物参考标准，包括Zymo Research（Zymobiomics®），生物分子资源设施协会（ABRF）元基因组研究小组（I类MRGR标准）和国家标准研究所和测试和测试vwin国际官网（nist）。虽然目前只有这些整个细胞和基因组学标准中只有少数几个，但目前正在制造包括真核和原核生物以及RNA的复杂混合物在内的未来标准。

使用微生物参考标准是任何微生物组项目的重要成分

Zymobiomics®微生物社区标准是一个模拟微生物群落，由8种细菌和2种真菌菌株（3革兰加经，5克阳性和2个酵母）组成，其中7个为人类病原体。相反，ABRF MGRG对照包括10种属于I类基因组的菌株，包括革兰氏阴性和阳性和1个古细菌，但不包括人类病原体相关菌株。NIST产生了几种微生物标准，最新的是与人类微生物组相关的微生物DNA面板，并于2017年底发行日期。Zymo Research和ABRF均提供全细胞微生物标准，这对于确定DNA提取效率是绝对必要的或用作样品/矩阵尖峰进行恢复确定，这无疑是当今大多数DNA套件中最大的缺点之一。

无论研究如何，无论是临床FMT样品，来自土壤或食物的常规元基因组样品，还是DNA提取效率研究，使用微生物参考标准是任何微生物组项目的重要组成部分，因为它将启用生物学家，软件，软件开发人员和产品生产以确定其过程中每个点的效率。