Metagenomics如何减少食物召回
下一代食品安全
从Chipotle.大肠杆菌2016年爆发，到了2018年的全国宽的罗马莴苣召回，食品安全事件经常制造头条新闻 - 并充分理体。即使美国农业部（USDA）和食品和药物管理局（FDA）定期监测食品供应链，据估计，4800万美国人每年仍然合同某种形式的食品疾病1。这部分是由于测试和召回是反动的，而不是预防性。
事实上，经常批准的筛选和检测方法利用培养技术需要花费五天时间来产生结果。传统上，这些方法涉及采取样品并将其生长在培养皿中以测试沙门氏菌，最常见的食物召回的病原体2。然而，食品供应商开始利用现代微生物组的监测技术来检测样品中的所有微生物，包括污染物。将这些强大的技术应用于早期测试，展示了预防昂贵的食物回忆并增加公共食品安全的保护。
农场到表
来自IBM和MARS，Inc。的研究人员正在引领基于微生物组的食品安全性，并创造了食品供应链联盟（SFSCC）的测序3.。该组织的目标是通过在食品供应链中的每一步，从农场的土壤中使用下一步测序和微生物组分析，从农场的土壤到超市来实现全球食品安全和最佳实践1,3。为了帮助他们的长期研究家禽安全性，使用全基因组测序，SFSCC编制了没有病原体的禽类的参考微生物组。然后可以将该参考微生物组用作批次禽肉中的潜在病原体的代理。在本研究期间，在大多数家禽样品中出现的基线微生物组，并且该基线的突然转变将表示存在潜在病原体的存在1。
使用这些方法，可以在食物处理链的任何阶段，从农场到消费者的任何阶段都可以检测这些变化。随着全基因组测序，研究人员和食品安全监视器不仅识别沙门氏菌，但数百种其他生物和可能导致疾病的细菌的血清型。通过这种能够在食品生产过程中检测更多病原体，食品安全可能处于从反动食品召回的巨大范式转变的点，以更具预防和积极的措施，以保持更多人的安全。
虽然该技术仍处于发育阶段，但在世界各地科学家的不断努力，微生物识别的许多进展已经推动。此外，通过影响消费者健康的能力，基于NGS的食品安全至关重要，以准确识别潜在的病原体。SFSCC进行的这项研究突出了重要性明确定义的微生物组参考资料通过开发家禽参考在硅中。通过推进这些技术，可以为所有食品应用这些方法，并将食物安全监测保持为更高的标准。德赢vwin体育官方网址
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学到更多参考：
1.豆C.内部工作：公司使用微生物组方法寻求食品安全。PNAS 2017,114（51）：13306-13308。
2.史密斯C.用于食物污染的测试。生物组合。
3。用于测序食品供应链的联盟。
