如何从Trizol中难以散热的样品中提取RNA®

学习针对挑战样本类型的最佳提取方法

RNA隔离的挑战

RNA隔离是一个具有挑战性的程序。与高度稳定的DNA不同,RNA非常不稳定,如果没有立即抑制其活性,则RNase酶会很快消化。传统的RNA隔离协议也很乏味,耗时且不可计入。由于RNA隔离对于许多科学企业至关重要,因此研究人员对协议和试剂进行了优化,以加快和简化过程。

RNA隔离方案中的一种流行试剂是Trizol®。由单相溶液中的苯酚和鸟嘌呤硫氰酸苯胺组成®(或TRI试剂®)是一种细胞裂解和RNase抑制溶液,用于从生物样品中同时分离RNA,DNA和蛋白质。TRI试剂的组件®促进对RNase活性的立即有效抑制,并分离从人类,动物,植物,酵母,细菌和病毒样品中分离出RNA,并在所有量的组织或培养细胞上保持一致的性能。

Trizol®用于从一系列样品中隔离RNA

Trizol®专门配制以将总RNA与现代研究实验室中的任何样本类型分离,无论是在学术界还是工业中:细胞,难以裂解或固体组织以及传染性生物学样品。

细胞

Trizol®允许从细胞中有效分离RNA,因为它迅速分解了细胞结构并使样品中的RNase失活,从而保护RNA免受降解。

难以散热的样品或固体组织

Trizol的化学构成®还借助于机械匀浆和/或蛋白酶K处理,促进了从难以散热的细胞和组织样品中释放RNA。

传染性生物样品

Trizol®使血浆,血清,粪便,血液和其他生物样品类型中的病原体失活,从而消除了研究人员的感染风险并简化RNA提取。

用Trizol提取有效RNA的技巧®

用Trizol提取RNA®将苯酚和鸟胺硫氰酸酯结合在单相溶液中,促进立即有效抑制RNase活性。但是,在制备生物样品进行RNA隔离时,应考虑到最佳结果的某些考虑。以下是一些样品制备技巧,可确保从细胞,难以散热/固体组织和传染性生物样品中提取有效的RNA:

细胞

由于其细胞结构,哺乳动物细胞最容易在Trizol中裂解®,通常不需要其他化学裂解或机械均质化。为了最大化RNA隔离效率,在制备Trizol中的细胞时遵循以下效率®

  • 添加1毫升Trizol®到5-10 x 106新鲜的,沉淀的哺乳动物细胞。移液管上下,直到细胞完全裂解和同质。
  • 提示1:如果裂解物保持阴云密布,不透明和/或粘性,请增加Trizol的体积®直到清除。
  • 提示2:用Trizol裂解后®,以最大速度离心1-2分钟,然后在加工前将上清液转移到新管中。在旧管的底部留下至少50μl,以避免转移颗粒的一部分。

难以散热/固体组织和传染性生物样品

固体组织,包括心脏,肺,肝脏,肌肉和软骨,比细胞更难裂解。另外,革兰氏阳性细菌和酵母细胞(例如:芽孢杆菌,李斯特菌,糖疗)也被认为是由于其细胞壁中的多糖而难以散热。

传染性生物样品,例如血浆,血清,粪便和全血是复杂的,高度蛋白质的样品,具有易于且易于散热的组件的混合物,因此应像难以散热的样品一样处理。为了最大化RNA隔离效率,请在制备trizol中固定样品,固体组织和感染性生物样品时遵守以下内容®

  • 提示1:与细胞不同,这些样品类型需要额外的化学裂解和/或机械均质化。
    • 我们建议机械均质化作为裂解这些样品的最佳方法。对于高速均质化(例如,伯丁蛋白的预素),添加1 ml trizol®到新鲜的组织样品(10%w/v),并以最大速度拍打30-60秒。对于低速均质化(例如,破坏者精灵),以最大速度跳动5-10分钟。确切的时间依赖样本类型。
    • 也可以在有或没有机械均质的情况下进行蛋白酶K处理的化学裂解。如果进行机械均质化,请在蛋白酶K中处理样品30分钟。如果没有,将蛋白酶K治疗时间增加到2-5小时。
  • 提示2:均质化和/或蛋白酶K处理后,在纯化之前将任何碎屑离心,然后将上清液转移到新管中。
  • 提示3:如果上清液/裂解物仍然多云,不透明和/或粘性,请增加Trizol的体积®直到清除。
如何在Trizol工作流程中提取RNA的RNA
当用直接ZOL RNA试剂盒提取RNA时,只需在自旋柱中添加Trizol样品,在7分钟内结合,洗涤和洗脱高质量RNA。

用直接Zol RNA套件在7分钟内从Trizol提取RNA

传统的Trizol®RNA提取是一种精致的,耗时的协议。一旦细胞裂解,则必须通过添加溴氯丙烷或氯仿并离心样品来分离匀浆。离心后,可见三个阶段:水相(RNA),有机相(DNA)和相间(蛋白质)。

通过添加异丙醇,用乙醇洗涤并溶解最终的RNA颗粒,从水相沉淀了RNA。这个过程的每个步骤都是乏味且耗时的,整个过程需要一个多小时,并且必须谨慎执行。RNA的产量和纯度通常由于细胞裂解不完全而受到损害,苯酚相对水相的污染或不完全溶解的最终RNA颗粒。

Direct-Zol RNA套件Zymo Research旨在与Trizol合作®,Tri试剂®,或基于类似的酸 - 瓜氨酸基因试剂,仅在七分钟内就可以从任何样品中获得总RNA提取,包括小/miRNA。使用Direct-Zol RNA试剂盒,您将获得一致的结果,与常规RNA隔离方法相比,RNA产量更高(多达四倍),并且更快的处理时间。无需氯仿或相分离,也没有沉淀步骤,消除了水相污染和不完全溶解的RNA颗粒。

要将RNA与Direct-Zol RNA试剂盒分离,只需在Trizol中添加样品®直接到Zymo-Spin柱,然后结合,洗涤并洗脱RNA。所得无DNA的RNA已准备好用于任何下游应用,包括下一代测序(NGS),RT/QPCR,Northern blots和其他需要纯RNA的方案。

直接ZOL方法也可以与Direct-Zol-96 Magbead RNA套件,它与任何机器人样品处理器(例如汉密尔顿,翠鸟和泰肯)兼容 - 进行高通量,快速提取任何研究实验室可访问的高质量RNA。

快速,有效的RNA提取的经验

RNA提取不一定是您科学方案中令人恐惧的一部分。Direct-Zol RNA试剂盒使RNA从任何样品类型(包括难以裂解/固体组织样品)中隔离。由于其无与伦比的速度和能够分离出各种细胞和组织类型的纯RNA的能力,因此直接-Zol RNA试剂盒是从TRIZOL中的样品中提取RNA的最佳溶液®。如果您想亲自体验快速,可扩展的RNA提取的力量,请访问我们的网站要了解有关直接Zol RNA套件的更多信息请求您的免费样品。

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