La Wastewater讲述了一个监控Covid-19的故事

拉县如何在废水中追踪Covid-19浪涌

在洛杉矶县,很少有资源与居民与水一样珍贵。vwin国际官网除了在沙漠中的民事成功之外,县里的内容讲述了触及它的每一个生命的故事。

洛杉矶县卫生区(Lacsd)致力于保护和监控洛杉矶县的供水。每天在四个主要的Lacsd水填海厂加工5.8亿加仑废水。通过深海管道泵出接受初级和二次处理的水。但是,Lacsd的大部分设施也表现了一个三级处理,以产生灌溉用水,并被释放到河流中进行再利用。

Covid-19已添加到Lacsd水循环使命的范围。该部门不仅要确保再生水是没有SARS-COV-2的,而且还监测废水中的SARS-COV-2 RNA水平可以帮助识别危险的群体普及感染的社区。

“我们只是想做我们的一部分。每个大流行的人都受到某种方式影响了,所以当我们意识到这项工作可以帮助我们的社区再次制作,这是一个非常容易的决定。“

瑞安重素,Lacsd的研究科学家

令人生畏的目标

lacsd有四个主要目标。前两种是开发一种在废水中量化SARS-COV-2 RNA的方法,然后在两种废水上使用该方法来治疗植物和离开它们的流出物。然后他们必须确定是否有发现的SARS-COV-2信号来自传染病。最后,LACSD必须在近期实时测量该数据以确定该数据是否可用于检测群落SARS-COV-2感染。

“我们只是想做我们的一部分。每个大流行都在某种程度上受到了影响的影响,所以当我们意识到这项工作可以帮助让我们的社区再次安全,这是一个非常简单的决定,“Lacsd的研究科学家Ryan Reinke说。

从废水中检测来自冠状病毒的RNA
La County Satititic地区的技术人员在使用Quick-RNA粪便/土壤微生物微生植物套件的RNA提取之前等待具有已知SARS-COV-2的废水。

该项目需要RNA纯化试剂盒,其具有优异的抑制剂去除并允许小洗脱体积。快的-RNA FECAL /土壤微生物Microprep套件符合所有要求,并选择了项目。

“在较小的体积中洗脱的能力使我们能够将RNA从废水中浓缩,而无需将废水本身浓缩,这将导致病毒RNA的变异性和丧失,”Reinke说。“我们与套件的经验是它产生非常一致和可重复的数据,同时获得非常高的RNA恢复。”

Lacsd的创新协议利用了快的-RNA粪便/土壤微生物微生物试剂盒,其能够以简单,可靠和快速的方式从各种土壤,污泥,沉积物和/或粪便样品中纯化包括小RNA(> 17nt)的总RNA。

在需要进行Covid-19测试的这些挑战时间内,废水监测是研究人员的理想方法,以获得一个区域中受感染的人数的更好范围。

方法和结果

每天于4月13日至8月19日在他们的圣何塞溪水填海工厂(SJC)以及联合水污染控制厂(JW)的情况下收集了流水废水。将每个部位进行取样,储存在15ml锥形管中的5ml流入物。

图形
图1 4月13日至8月19日在圣何塞溪水填海工厂以及联合水污染对照植物中追踪的1 SARS-COV-2浓度(每升数百万颗粒)。然后观察到的每日病毒RNA浓度纳入LA县内的SARS-COV-2新病例的7天。

每天,总共六个(250μl)等分试样从相应的5mL样品中取出并立即储存在750μL中DNA / RNA屏蔽。DNA / RNA屏蔽灭活病毒并在室温下保存核酸30天;该运输媒体用于超过12个FDA欧盟授权SARS-COV-2测试工作流程。将三次等分试样储存在-80°C冷冻机中,因为在灭活废水上进行三次重复的RNA提取,总共六个萃取。使用Zymo Research进行RNA纯化快的-RNA粪便/土壤微生物微生膜套件。

疾病疾病疾病疾病疾病疾病指南,逆转转录和QPCR扩增SARS-COV-2基因组的N1和N2区的QPCR扩增。然后绘制病毒拷贝数对洛杉矶县区的SARS-COV-2新病例的7天平均值(图1)。1,2

未来的蓝图?

虽然在废水中发现SARS-COV-2 RNA信号,但治疗设施在消除病毒方面有效,并且再生水是安全的。数据还表明,这种类型的病毒监测可能是识别社区中的Covid-19“热点”的快速且具有成本效益的方式,以便资源可以迅速指导到这些区域来管理和包含病毒的传播。vwin国际官网

Lacsd的Covid-19废水监测项目不仅被证明是一种检测和追踪潜在爆发的方法,但它可以作为其他废水设施的蓝图,当未来的社区面临传染性威胁时,在监测病毒疾病时。在越来越越来越越来越跨越的世界中,全球流行病可能会继续作为公共卫生威胁。然而,通过适当的保障,政策和病毒监测计划,可以比以往任何时候都更准备 - 从而保护当地经济,降低医疗费用,最重要的是,挽救生命。

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参考

  1. 洛杉矶县卫生区。废水中新型冠状病毒的测试。Lacsd.org,2020年6月
  2. 洛杉矶县卫生区。测试冠状病毒 - 最新数据的污水。Lacsd.org 2020年9月
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