了解原始NGS数据

对于几乎每个NGS分析,前两个关键步骤是以FASTQ文件的形式生成原始读取以及这些读取与参考基因组以创建SAM/BAM文件的对齐。了解这些文件的编写方式以及每个读取的不同字段的详细信息可以提高对NGS分析和随后的下游应用程序的理解。

在以下视频中,了解:

  • QSEQ与FastQ文件
  • 解释读取质量字符串
  • Sam vs. BAM文件
  • 解释雪茄弦
  • 解释标志值
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