有针对性的亚硫酸盐测序服务

间谍玻璃看DNA

Zymo Research通过我们的MethylCheck™平台简单地使表观遗传生物标志物验证变得简单。无论您是否有甲基化阵列(27K/450K/850K)的数据,您想在大型样品队列中验证,或者考虑到特定的基因区域,我们的科学家都可以设计,验证和评估特定地点的DNA甲基化变化。德赢vwin体育平台入口只需向我们发送您感兴趣的样本和区域,我们将通过数据分析执行每一步,从而向您发送出版物质量图和图形。

目标的甲硫酸盐测序服务包括:
  • 底漆设计和验证
  • 有针对性的扩增
  • 调整和条形码
  • 使用Illumina™技术测序
  • 序列比对参考基因组
  • 德赢vwin体育平台入口DNA甲基化分析

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DNA甲基化分析的工作流德赢vwin体育平台入口程
引用

威尔莫特,。使用Zymo研究中的靶向亚硫酸盐测序服务来验证儿童ADHD中的差异甲基化区域。研究人员从唾液中提取了DNA,以分析样品源外周向脑组织中的甲基化模式。遵循全基因组差异甲基化区域分析,使用珠阵列,研究作者确定了VIPR2作为多动症感兴趣的基因。靶向亚硫酸盐测序证实了43位ADHD受试者中的43个地点的甲基化,包括VIPR2,从而为使用外周组织作为精神疾病中甲基化分析的潜在样品来源提供了进一步的信心。

研究人员研究了先兆子痫背后的机制,使用了Zymo Research的靶向亚硫酸盐测序服务来检查人乳肠蛋白编码的三个基因的DNA甲基化状态。德赢vwin体育平台入口怀疑在19号染色体上发现的基因簇中发现的甘染蛋白可赋予孕产妇免疫耐受性。设计扩增子覆盖胎盘乳肠蛋白基因LGALS13,LGALS14和LGALS16的高度甲基化基因内区域。使用此策略,发现几个关键的CpG位点与先兆子痫相关。结合其他测定法,研究结果表明,这些位点的差异甲基化可能会影响或干扰簇乳肠蛋白基因的滋养细胞转录。

比ng,等。(2014)染色体19簇半凝集素的胎盘表达的进化起源及其在先兆子痫中的复杂失调。胎盘35(11):855-865。

研究人员利用Zymo Research的甲基Miniseq和靶向的亚硫酸盐测序服务来识别和验证与非洲裔美国人的结直肠癌(CRC)相关的甲基化标记。用甲基Miniseq的全基因组甲基化分析显示,除了CRC样品中的低甲基化长期散布元素(线)外,除了13个基因中,有355个差异甲基化的CpG位点。此外,这些基因中有六个包含50个具有最高差异甲基化度的CpG,然后使用42个样品和靶向的亚硫酸盐测序进一步研究。随着样品集和更为集中的测序,作者能够验证四个基因EID3,BMP3,GAS7和GPR75,作为非裔美国人患者的新型CRC甲基化标记。

Ashktorab,H等。(2014)DNA甲基分析鉴定出大型肿瘤患者的新型甲基化基因。表观遗传学。9(4):503-512
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