Zymo-Seq RRBS图书馆套件
D5460 / D5461
Zymo-Seq RRBS图书馆套件
| 猫 ＃ | 姓名 | 尺寸 | 价格 | 数量 |
|---|---|---|---|---|
| D5460 | Zymo-Seq RRBS库套件（24个准备） | 24个准备 | $ 1,200.00 |
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| D5461 | Zymo-Seq RRBS库套件（48个准备） | 48个准备 | $ 2,250.00 |
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文件
强调
- 简单的工作流程：准备减少的表示Bisulfite测序（RRBS）库，仅在2个小时的动手时间。
- 低输入：从≥10ng的基因组DNA产生NGS文库的唯一RRB套件。
- 准确且可重复：公正的甲基化呼叫和可重现的CPG覆盖范围。
描述
| 需要设备 | 带有加热盖的热离心机，热循环仪 |
|---|---|
| 输入 | 10 - 500 ng的基因组DNA |
| 样品来源 | 纯化的基因组DNA。DNA应不含酶促抑制剂，并且可以悬浮在水，TE或低盐缓冲液中。在处理之前，应纯化具有低260/280或260/230比率的DNA基因组DNA清洁和浓缩器（CAT。D4010）。不建议使用CPG密度低的物种的样品使用此方案。 |
| 测序平台兼容 | 图书馆与Hiseq X系列除外的所有Illumina测序平台兼容。 |
| 补充信息 |
Q1：Zymo-Seq RRBS库套件是否提供了所有必要的试剂来生成库以减少表示的Bisulfite测序？
是的。有了这个多合一套件，您可以使用您感兴趣的基因组DNA生成RRBS库。但是，未提供用于图书馆量化和尺寸分配表征的试剂，客户和/或其测序服务提供商需要提供，以确保测序的最佳实践。
Q2：使用此套件时，样品物种是否有任何限制？
原则上，只要存在用于随后的生物信息学分析的参考基因组，并且基因组DNA的质量高（良好的拇指规则规则规则）对于“高质量”来说，DNA几乎没有降解，大多数内容高于10 kb）。
Q3：我可以使用该试剂盒使用少于10 ng的基因组DNA吗？
可以生成少于10 ng的基因组DNA的文库；但是，不能保证此类图书馆的质量。
Q4：我可以使用从FFPE样品中提取的DNA使用此套件生成RRBS库吗？
可以用从FFPE样品中提取的DNA生成库。但是，由于这种DNA的降解，库的质量将受到影响。增加输入金额可能会有所帮助，但不能保证库的质量。
Q5：建议输入DNA使用哪种定量方法？
我们使用纳米体或量子量化输入DNA，但是任何方法都应这样做。输入基因组DNA应不含RNA。
Q6：使用此套件，我可以在单个车道中多路复用和序列有多少个库？
我们提供12个预混合的唯一双索引（UDI）引物设置，因此您可以多重多达12个库。如果您想多重多重，请分别订购Zymo-Seq UDI底漆板（索引1-96，CAT。D3096）。
Q7：使用此套件生成的每个库的预期收益率是多少？
每个库的产量取决于输入基因组DNA和其他因素的质量。通常，在遵循说明手册中建议的PCR周期时，每个库的产量约为300 ng或更多（如果用纳米体定量）。
Q8：测序RRBS库时，我应该寻找什么读取长度和序列深度？
最佳读取长度和序列深度取决于项目的目标和随后的生物信息学分析。通常，在处理哺乳动物样品时，应进行50 bp单端或配对的测序，因为RRBS库通常具有相对较短的插入片段。如果要覆盖尽可能多的CPG站点，也可以使用更长的读取长度。此外，建议每个CpG位点5-10倍平均覆盖率。
“ Zymo-Seq RRBS套件的简单性令人印象深刻。该套件使研究人员能够使用易于使用的协议来询问基因组DNA甲基化，并且相对较少的动手可以按时进行，并产生可靠和可重现的结果。德赢vwin体育平台入口methods, this is by far the easiest protocol I have come across: a researcher who has never done a library preparation or who is new to researching DNA methylation could use this kit with confidence. We were further impressed with the kit’s ability to tolerate low inputs down to 10ng, and because of this we were able to confidently assess methylation patterns in the embryonic chicken using minimal DNA input. In the past we have used whole genome bisulfite sequencing to investigate DNA methylation, but with the availability of this kit, we have turned our attention to RRBS as a cost-effective alternative that does not have the restriction of needing a large amount of DNA input to yield sufficiently complex libraries. In the future we are very likely to purchase this kit for use in other projects, including applications to human iPSC cultures, avian, and amphibian models."
- Jared T.（迈阿密大学）
| 猫 ＃ | 姓名 | 尺寸 | 价格 | |
|---|---|---|---|---|
| D4014 | DNA清洁和浓缩器-5（上限） | 200个准备 | $ 294.00 | |
| D4013 | DNA清洁和浓缩器-5（上限） | 50个准备 | $ 81.00 | |
| D3004-4-1 | DNA洗脱缓冲液 | 1毫升 | $ 11.00 | |
| D3004-4-10 | DNA洗脱缓冲液 | 10毫升 | $ 14.00 | |
| D3004-4-16 | DNA洗脱缓冲液 | 16毫升 | $ 18.00 | |
| D3004-4-4 | DNA洗脱缓冲液 | 4毫升 | $ 10.00 | |
| D3004-4-50 | DNA洗脱缓冲液 | 50毫升 | $ 32.00 | |
| W1001-1 | DNase/无RNase水 | 1毫升 | $ 10.00 | |
| W1001-10 | DNase/无RNase水 | 10毫升 | $ 19.00 | |
| W1001-30 | DNase/无RNase水 | 30毫升 | $ 22.00 | |
| W1001-4 | DNase/无RNase水 | 4毫升 | $ 12.00 | |
| W1001-6 | DNase/无RNase水 | 6毫升 | $ 15.00 | |
| D4003-1-25 | DNA结合缓冲液 | 25毫升 | $ 21.00 | |
| D4003-1-L | DNA结合缓冲液 | 50毫升 | $ 33.00 | |
| D4003-2-24 | DNA洗涤缓冲液（浓缩物） | 24毫升 | $ 33.00 | |
| D4003-2-48 | DNA洗涤缓冲液（浓缩物） | 48毫升 | $ 60.00 | |
| D4003-2-6 | DNA洗涤缓冲液（浓缩物） | 6毫升 | $ 10.00 | |
| D5001-3 | M结合缓冲液 | 20毫升 | $ 14.00 | |
| D5002-3 | M结合缓冲液 | 80毫升 | $ 38.00 | |
| D5040-3 | M结合缓冲液 | 250毫升 | $ 105.00 | |
| D5001-4 | M洗涤缓冲区 | 6毫升 | $ 10.00 | |
| D5002-4 | M洗涤缓冲区 | 24毫升 | $ 25.00 | |
| D5007-4 | M洗涤缓冲区 | 36毫升 | $ 37.00 | |
| D5040-4 | M洗涤缓冲区 | 72毫升 | $ 68.00 | |
| D5005-3 | M结合缓冲液 | 30毫升 | $ 20.00 | |
| D5006-3 | M结合缓冲液 | 125毫升 | $ 58.00 | |
| D5030-5 | L-脱硫化缓冲液 | 10毫升 | $ 15.00 | |
| D5031-5 | L-脱硫化缓冲液 | 40毫升 | $ 42.00 | |
| D5046-5 | L-脱硫化缓冲液 | 80毫升 | $ 74.00 | |
| D5030-1 | 闪电转换试剂 | 1.5毫升 | $ 23.00 | |
| D5032-1 | 闪电转换试剂 | 15毫升 | $ 136.00 | |
| D5016 | 大肠杆菌非甲基化基因组DNA | 5 µg/20 µL | $ 113.00 | |
| D5030T | EZ 德赢vwin体育平台入口DNA甲基化试剂盒 | 10 rxns。 | $ 45.00 | |
| D5030 | EZ 德赢vwin体育平台入口DNA甲基化试剂盒 | 50个RXN。 | $ 193.00 | |
| D5031 | EZ 德赢vwin体育平台入口DNA甲基化试剂盒 | 200 rxns。 | $ 547.00 | |
| C1001-50 | 收集管 | 50包 | $ 15.00 | |
| C1001-500 | 收集管 | 500包 | $ 52.00 | |
| C1001-1000 | 收集管 | 1000包 | $ 90.00 | |
| C1004-50 | Zymo-Spin IC列 | 50包 | $ 53.00 | |
| C1004-250 | Zymo-Spin IC列 | 250包 | $ 228.00 | |
| D4004-1-L | DNA结合缓冲液 | 100毫升 | $ 57.00 | |