Zymo-Seq WGBS Library Kit

D5465


Zymo-Seq WGBS Library Kit

猫# 名字 大小 价格 数量
D5465 Zymo-Seq WGBS Library Kit 24日家庭作业 889.00美元
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文档



突出了

  • 全基因组亚硫酸氢盐(WGBS)文库制备在不到4小时,在一个管。
  • 减少库准备偏差,以实现精确的甲基化调用
  • 任何物种的可复制基因组覆盖率(>在哺乳动物样本中检测到90%的CpG位点)
描述

Zymo-Seq WGBS文库试剂盒是唯一一种在单管中制备全基因组亚硫酸氢盐(WGBS)文库的试剂盒。Zymo-Seq WGBS文库试剂盒结合了修饰技术,以消除传统的基于结扎的文库制备方法所需要的繁琐的碎片、酶和清理步骤。这种简化的工作流程最大限度地减少了实际操作时间,使其成为高吞吐量应用程序的理想选择。为了制备Zymo-Seq WGBS文库,完整的基因组DNA首先被亚硫酸氢盐转化。然后,在单管中完成以下文库制备程序:(1)第二链合成,(2)通过tagentation进行适配,(3)文库扩增和标引。纯化后,文库就可以在Illumina仪器上测序了。


WGBS是DNA甲基化研究的金标准,因为它为所有胞嘧啶提供了德赢vwin体育平台入口基础水平的甲基化量化。Zymo-Seq WGBS Library Kit适用于任何物种的CG, CHG和CHH位点的全基因组甲基化调用。从Zymo-Seq文库中可以检测到90%以上的人和小鼠CpG位点。


DNA的输入 为获得最佳结果,使用100 ng高质量、完整的基因组DNA作为输入。协议兼容10ng到100ng之间的输入。DNA应该没有酶抑制剂和RNA污染。DNA可以在水、TE或低盐缓冲液中重新悬浮。
处理时间 ~ 4小时
必需的设备 微离心机,带加热盖的热循环器,磁选机,多道移液管(建议)
未提供所需材料 Illumina DNA准备试剂盒(Illumina, Cat。编号20018704或20018705)
测序平台 库兼容所有Illumina测序平台(MiSeq, MiniSeq, HiSeq, NextSeq, NovaSeq)
补充信息

不。Illumina DNA准备试剂盒(Cat。编号为20018704或20018705),必须直接从Illumina购买。

不。该套件提供十二(12)种独特的双索引引物集。如果您需要更多的索引引物,请联系我们的技术支持以获得帮助(949) 679-1190分机tech@zymoresearch.com

输入基因组DNA的大小对于高质量和高产文库至关重要。FFPE样品的DNA往往高度降解,因此文库的质量会受到影响。无细胞DNA与试剂盒不兼容,因为片段尺寸太短,无法进行有效的标记。

Zymo-Seq WGBS文库试剂盒兼容从任何物种中提取的基因组DNA,无论是哺乳动物、细菌还是植物。最好使用无rna的高质量、完整的基因组DNA。

库适用于任何循环数,但增加循环数将需要更大量的适配器修整。对于大多数人来说,100 bp配对端读数是合适的。测序深度将取决于所需的基因组大小和覆盖范围。一般来说,建议将每个CpG站点的覆盖率定为10倍。

所需覆盖的读取数(N)可以通过以下公式来估计:N =(覆盖)*(二倍体基因组长度)/读取长度。亚硫酸氢盐转换降低了基因组的复杂性,与DNA-seq相比,具有更低的比对率,因此建议将读取数增加25%。因此,对于10倍覆盖率的人WGBS,使用100 bp PE测序,建议至少4亿次读取。

Zymo-Seq WGBS试剂盒是研究高输入(10-100ng)基因组DNA的理想选择。它具有最少的处理和清理步骤,这使它成为高通量库生成的理想选择。

Pico Methyl-Seq对于那些处理小DNA输入(< 10ng)或高片段DNA(如cfDNA或FFPE DNA)的人来说是一个更好的选择。



猫# 名字 大小 价格
D5016 大肠杆菌非甲基化基因组DNA 5µg/20µl 113.00美元
D5030-1 闪电转化试剂 1.5毫升 27.60美元
D5001-3 M-Binding缓冲 20毫升 16.80美元
D5001-4 M-Wash缓冲 6毫升 12.00美元
D5030-5 L-Desulphonation缓冲 10毫升 18.00美元
D3004-4-1 DNA洗脱缓冲液 1毫升 12.10美元
W1001-1 DNase / RNase-Free水 1毫升 11.00美元
C1004-50 Zymo-Spin IC柱 50包 58.30美元
C1001-50 集合管 50包 16.50美元
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