Zymo-Seq WGBS Library Kit
D5465
Zymo-Seq WGBS Library Kit
猫# | 名字 | 大小 | 价格 | 数量 |
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D5465 | Zymo-Seq WGBS Library Kit | 24日家庭作业 | 889.00美元 |
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文档
![Zymo-Seq WGBS Library Kit](https://cdn.shopify.com/s/files/1/0016/3731/8726/products/d5465-zymo_seq_wgbs_library_kit_large.jpg?v=1629217194)
突出了
- 全基因组亚硫酸氢盐(WGBS)文库制备在不到4小时,在一个管。
- 减少库准备偏差,以实现精确的甲基化调用
- 任何物种的可复制基因组覆盖率(>在哺乳动物样本中检测到90%的CpG位点)
描述
DNA的输入 | 为获得最佳结果,使用100 ng高质量、完整的基因组DNA作为输入。协议兼容10ng到100ng之间的输入。DNA应该没有酶抑制剂和RNA污染。DNA可以在水、TE或低盐缓冲液中重新悬浮。 |
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处理时间 | ~ 4小时 |
必需的设备 | 微离心机,带加热盖的热循环器,磁选机,多道移液管(建议) |
未提供所需材料 | Illumina DNA准备试剂盒(Illumina, Cat。编号20018704或20018705) |
测序平台 | 库兼容所有Illumina测序平台(MiSeq, MiniSeq, HiSeq, NextSeq, NovaSeq) |
补充信息 |
Q1: Zymo-Seq WGBS文库试剂盒是否提供生成测序文库所需的所有试剂?
不。Illumina DNA准备试剂盒(Cat。编号为20018704或20018705),必须直接从Illumina购买。
我需要单独购买引物吗?
不。该套件提供十二(12)种独特的双索引引物集。如果您需要更多的索引引物,请联系我们的技术支持以获得帮助(949) 679-1190分机或tech@zymoresearch.com.
Q3:我可以使用降解的样本,如FFPE DNA或无细胞DNA,从这个试剂盒生成WGBS文库吗?
输入基因组DNA的大小对于高质量和高产文库至关重要。FFPE样品的DNA往往高度降解,因此文库的质量会受到影响。无细胞DNA与试剂盒不兼容,因为片段尺寸太短,无法进行有效的标记。
问题4:Zymo-Seq WGBS库套件兼容什么类型的输入?
Zymo-Seq WGBS文库试剂盒兼容从任何物种中提取的基因组DNA,无论是哺乳动物、细菌还是植物。最好使用无rna的高质量、完整的基因组DNA。
Q5: WGBS库建议的读取长度和测序深度是多少?
库适用于任何循环数,但增加循环数将需要更大量的适配器修整。对于大多数人来说,100 bp配对端读数是合适的。测序深度将取决于所需的基因组大小和覆盖范围。一般来说,建议将每个CpG站点的覆盖率定为10倍。
所需覆盖的读取数(N)可以通过以下公式来估计:N =(覆盖)*(二倍体基因组长度)/读取长度。亚硫酸氢盐转换降低了基因组的复杂性,与DNA-seq相比,具有更低的比对率,因此建议将读取数增加25%。因此,对于10倍覆盖率的人WGBS,使用100 bp PE测序,建议至少4亿次读取。
Q6: Zymo-Seq WGBS Library Kit和Pico Methyl-Seq Kit有什么区别?我应该用哪一个?
Zymo-Seq WGBS试剂盒是研究高输入(10-100ng)基因组DNA的理想选择。它具有最少的处理和清理步骤,这使它成为高通量库生成的理想选择。
Pico Methyl-Seq对于那些处理小DNA输入(< 10ng)或高片段DNA(如cfDNA或FFPE DNA)的人来说是一个更好的选择。
猫# | 名字 | 大小 | 价格 | |
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D5016 | 大肠杆菌非甲基化基因组DNA | 5µg/20µl | 113.00美元 | |
D5030-1 | 闪电转化试剂 | 1.5毫升 | 27.60美元 | |
D5001-3 | M-Binding缓冲 | 20毫升 | 16.80美元 | |
D5001-4 | M-Wash缓冲 | 6毫升 | 12.00美元 | |
D5030-5 | L-Desulphonation缓冲 | 10毫升 | 18.00美元 | |
D3004-4-1 | DNA洗脱缓冲液 | 1毫升 | 12.10美元 | |
W1001-1 | DNase / RNase-Free水 | 1毫升 | 11.00美元 | |
C1004-50 | Zymo-Spin IC柱 | 50包 | 58.30美元 | |
C1001-50 | 集合管 | 50包 | 16.50美元 | |