快速-16S NGS库准备试剂盒

D6400 / D6410


快速-16S NGS库准备试剂盒

猫# 的名字 大小 价格 数量
D6400 快速-16S NGS库准备试剂盒 96年rxns 995.00美元
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D6410 快速-16S NGS库准备试剂盒 24 rxns 325.00美元
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文档

Quick-16S NGS文库准备试剂盒

突出了
  • 最快:只有1.5小时的动手时间。没有Tapestation®分析或AMPure®清理。
  • 准确:real-time PCR的应用限制了PCR嵌合体的形成。
  • 增加覆盖范围:新的引物增加了细菌和古生菌的系统发育覆盖范围，使人类微生物组分析的物种级分辨率成为可能。
描述

16S rRNA测序是微生物组组成分析的常规技术。与鸟枪宏基因组测序相比，16S rRNA测序更经济、更稳健;它通常需要较少的输入DNA，也较少受宿主DNA的影响。然而，16S rRNA测序也有其自身的挑战。一个主要的挑战是聚合酶链反应嵌合序列的形成，这是由两个或多个聚合酶链反应模板重组产生的人工序列。此外，使用普通的16S引物，很难实现种级分辨率和广泛的系统发育覆盖。此外，在现场使用的常用16S库准备协议还没有优化到适合大规模应用的成本效益。的快速16S NGS文库准备试剂盒旨在标准化16S rRNA测序的文库准备过程。该套件的特点如下所述。最快的16S rRNA库准备。的快速-16S NGS Library Prep Kit使用实时(定量)PCR (qPCR)而不是端点PCR进行16S rRNA扩增，可以直接定量PCR产物，无需额外的文库定量分析，如TapeStation分析或凝胶电泳。德赢vwin体育官方网址在两个PCR步骤之间引入了酶的清理，与冗长的AMPure珠基清理相比，节省了时间和降低了成本。有了这些特性，该套件极大地减少了16S库准备的实际操作时间。简单。的快速16S NGS文库准备试剂盒包括将96个DNA样本转化为16S文库所需的所有试剂。结果库与Illumina MiSeq直接兼容，不需要额外的自定义测序引物。准确的。利用实时PCR技术还可以使用户控制PCR周期。这限制了嵌合体的形成和PCR偏差，同时获得足够的产物用于后续测序。德赢vwin体育官方网址在大多数情况下，PCR嵌合序列丰度保持在2%以下。增加覆盖范围。由于16S rRNA数据库的快速扩展，常见的16S引物集的微生物覆盖率不足已成为显而易见的问题。Zymo Research基于最新的16S参考数据库，重新设计了两种针对16S V1-V2和16S V3-V4区域的通用引物集，并显著提高了它们的覆盖率。

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扩增子的大小 16S V1-V2区域和16S V3-V4区域(包括引物)的大小分别为~350bp和~460bp。加入条形码引物后的扩增子大小分别为~486bp和~596bp。
条形码序列 可以在这里
设备 微离心机，平板旋转器(离心机)，96孔实时定量PCR系统，96孔实时PCR板。
索引引物 双索引(条形码)对96个样品进行唯一标记。
制备> 96样品 如欲了解制备96个以上样品的指南，请点击这里．
推荐RT - PCR系统 Bio-Rad CFX96实时PCR检测系统(任意型号)，Applied Biosystems 7500实时PCR系统。
样例输入 纯化的微生物DNA≤20 ng/µl，不含PCR抑制剂。
测序的兼容性 Illumina MiSeq无需添加自定义测序引物。Zymo Research推荐MiSeq试剂试剂盒v3(600循环)。
补充信息

作者调查了与垃圾填埋场反应堆相关的微生物池，这些反应堆受到纳米材料的影响。通过使用Quick-16S NGS Library Prep Kit制备16S rRNA文库，他们发现在对照反应器和含纳米材料的反应器中，细菌群落是相似的，但古菌群落是高度不同的。

Akyol C。，奥兹巴拉姆，例如，德米雷尔，B.，奥内，t.t.，因斯，O.和因斯，B.(2019)。在卫生填埋场模拟中将纳米氧化锌污染与微生物群落分析联系起来。环境科学与污染研究doi: 10.1007/s11356-019-04906-8

本研究探讨了废水处理中不同交换率对微生物群落组成的影响。用fast -16S NGS Library Prep Kit进行16S测序的样品分析表明，变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)的相对丰度随着交换比的变化而变化，Thiothrix的物种在所有样品中都有很高的丰度，揭示了它们对废水处理过程的潜在重要性。

Karlikanovaite-Balikci, A.， Ozbayram, e.g.， Yagci, N.和Ince, O.(2019)。氧化—沉降—缺氧过程中微生物群落的变化与污泥交换比的变化有关。e01517 Heliyon 5(4)。doi: 10.1016 / j.heliyon.2019.e01517

Akyol等人使用Quick-16S NGS Library Prep Kit对厌氧沼地进行了16S和18S分析，以评估富含木质纤维素的沼地中的微生物多样性。最丰富的细菌和真菌属是一致的在digum样品。

Akyol C。，因斯，O和因斯，B.(2019)。以作物为基础的木质纤维素堆肥:关注细菌和真菌多样性。Bioresour。抛光工艺。, 121549年。doi: 10.1016 / j.biortech.2019.121549

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“这是一个非常好的图书馆准备工具包，特别是与其他图书馆准备产品相比。德赢vwin体育官方网址我们喜欢的是，我们需要准备一个靶向测序文库的所有试剂都包括在内!”

- Leyao w(圣路易斯华盛顿大学)

“我们在2018年的beta测试期间首次测试了该套件。我们非常喜欢它，并立即订购了完整的套件来改变我们的工作流程。”

- Lisa D.(霍恩海姆大学)

“这是一个非常棒的套件，我强烈推荐它。”

-卡琳娜·s(墨西哥米塞内斯大学)

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